熒光色素是常用于標記抗體的標記物之一。熒光素經恰當的激發可發光，從而得知抗體的定位和待測抗原的分布情況，主要用于細胞分選或高分辨率免疫染色，是一種非常好的亞細胞水平較準確定位的方法。

　　在確定選擇哪種標簽類型時，應側重于抗體的下游應用。熒光標簽主要用于細胞成像，流式細胞儀，熒光印跡和免疫熒光應用，而酶標（例如HRP和AP）通常用于WB，ELISA和IHC應用。Hapten標簽（例如生物素）在可能的標簽選項中用途更為廣泛，因為它們可用于蛋白質分離和純化以及任何上述應用。